Cuando la amenaza del ángel se intensifica, la fuerza de defensa de la humanidad es llevada al límite, con NERV al frente de la lucha. Shinji Ikari y su compañera Rei Ayanami son asistidos por dos nuevos pilotos: la fogosa Asuka Langley Shikinami y la misteriosa Mari Illustrious Makinami.
Con la ayuda de sus unidades Evangelion mecanizadas, equipadas con armas perfectas para enfrentar a sus monstruosos oponentes, las cuatro almas jóvenes luchan desesperadamente para proteger a sus seres queridos y evitar un apocalipsis inminente. Pero cuando se revelan secretos sorprendentes, ¿el mayor desafío de los héroes serán los monstruos... o la humanidad misma?
[Escrito por MAL Rewrite]