聖杯戦争は、マスターとして仕える7人の魔術師によるバトルロイヤルである。マスターは戦争に参加する際に与えられる令呪を用いて、サーヴァントとして知られる英霊を指揮し、戦わせる。第五次聖杯戦争では、遠坂凛が参加する魔術師の一人である。彼女は自分のサーヴァントであるアーチャーと共に、究極の賞品である聖杯——持ち主のあらゆる願いを叶えることができる魔法の神器——を手に入れようと望んでいる。
凛のクラスメートの一人、衛宮士郎は偶然にも競技に参加し、最終的にセイバーとして知られる自分のサーヴァントを指揮することになる。彼らが互いに敵に直面していることを知り、凛と士郎は一時的な同盟を結び、聖杯戦争で敵に挑むことを決意する。
[MAL Rewrite 執筆]