高校3年生の阿良々木暦は、廃墟ビルに住む怪しい男・忍野メメの助けを借りて、吸血鬼の襲撃を生き延びる。吸血鬼から救われ人間に戻ったものの、超人的な治癒力や強化された視力などの副作用は残っている。それでも暦は、友人であり生徒会長でもある羽川翼の助けを借りて、普通の学生としての生活を送ろうとしている。同級生の戦場ヶ原ひたぎが階段から落ちて暦に受け止められた時、彼は彼女が不自然に体重が軽いことに気づく。ひたぎの抗議にもかかわらず、暦は彼女を助けることを主張し、かつて自分の窮地を救った忍野に助けを求める。妖怪や神々をめぐるいくつかの物語を通して、化物語は暦が超自然的な病に苦しむ人々を助けようとする姿を描く。[MAL Rewriteによる]