緑谷出久(デク)と雄英高校ヒーロー科1年A組の仲間たちは、ナブ島の安全プログラムに参加することになった。より平凡なヒーロー活動を通じてスキルを向上させ、経験を積むため、生徒たちは親切な住民を助け、小さな奉仕や日常の雑務を行う。静かなコミュニティの低い犯罪率により、すべては順調に見えるが、新たな敵の出現が生徒たちの勇気を試し、ヒーローとしての能力に挑戦することになる。ナインという無慈悲な敵は、彼の悪魔的な計画—最強の個性だけが支配する社会を作ること—を実行するために特定の「個性」を探している。ナブ島への攻撃が住民の命を危険にさらす中、市民の安全を確保することが1年A組の最優先事項となる;ナインとその邪悪な共犯者を倒すことも不可欠だ。デクが友情を築いた幼い少年、島野勝真が突然特別な保護を必要とするまでは、単純な戦略が立てられていた。少年の幸福を心配するデクとクラスメートは、今やどんな犠牲を払ってでも勝真の安全を確保する計画を立てなければならない。ナインが大混乱を引き起こしながら探し