困ったとき、正しい場所を見れば、赤い文字で書かれた奇妙な電話番号が見えるかもしれません。その番号に電話をかけると、若い男が自分を「夜ト神」と名乗るのを聞くでしょう。
夜トは小さな神様で、自称「デリバリーゴッド」。何百万人もの信者を持つことを夢見ていますが、彼の名を冠した神社は一つもなく、目標はほど遠い状態です。彼は一日中、五円で雑用をこなし、ついには武器のパートナーが役立たずの主人に愛想を尽かして去ってしまいます。
神様にとって状況が暗くなりかけたその時、中学生の壱岐ひよりが、夜トを交通事故から救おうとして、代わりに犠牲になったことで運命が変わります。驚くべきことに彼女は生き延びますが、その出来事で彼女の魂が緩み、体を離れられるようになってしまいます。ひよりは夜トに元に戻すよう要求しますが、そのためには新しいパートナーが必要だと知り、しぶしぶ彼を探す手伝いをすることに。そしてひよりの助けにより、夜トの運命もようやく好転し始めるかもしれません。
[Written by MAL Rewrite]