먼 미래, 인류는 거대한 괴수 클락소사우루스에 의해 멸종 위기에 몰려, 생존자들은 플랜테이션이라는 거대 요새 도시로 도망쳤습니다. 그곳에서 자란 아이들은 소년과 소녀가 한 쌍이 되어 프랑크스라는 거대 메카를 조종하도록 훈련받습니다. 오직 파일럿이 되기 위해 태어난 이 아이들은 외부 세계에 대해 아무것도 모르고, 자신의 종족을 지키는 것만으로 존재를 증명할 수 있습니다.
프랑크스 파일럿 지망생 히로는 적성 검사에 실패한 후 의욕과 자신감을 잃었습니다. 졸업식을 빼먹고 숲속 호수로 물러난 히로는 머리에서 두 개의 뿔이 자란 신비한 소녀를 만납니다. 그녀는 코드네임 제로 투라고 자신을 소개하는데, 그녀는 '파트너 킬러'로 알려진 악명 높은 프랑크스 파일럿입니다. 히로가 그 만남을 소화하기도 전에, 플랜테이션은 갑작스러운 클락소사우루스의 공격을 받습니다. 제로 투는 자신의 프랑크스로 괴수와 교전하지만, 전투 중 심하게 손상되어 히로 근처에 추락합니다. 그녀의 파트너가 죽은 것을 발견한 제로 투는 히로에게 자신과 함께 메카를 조종하자고 제안하고, 둘은 이어지는 싸움에서 쉽게 클락소사우루스를 물리칩니다. 새로운 파트너와 함께 히로는 과거의 실패를 만회할 기회를 얻었지만, 그 대가는 무엇일까요? [출처: MAL Rewrite]