5년 동안 마음속에 품어온 감정을 표현하지 못한 고등학생 오오키 타이주가 드디어 오가와 유즈리하에게 고백하려 한다. 그러나 타이주가 고백을 시작하려는 순간, 눈부신 녹색 빛이 지구를 강타하고 전 세계의 인류를 돌로 만들어 버린다.
수천 년 후, 타이주는 깨어나 현대 세계가 완전히 사라지고 인류가 멈춰 있는 동안 자연이 번성한 것을 발견한다. 석상의 돌 세상 속에서 타이주는 또 다른 살아있는 인간을 만난다: 과학을 사랑하는 친구 센쿠로, 그는 몇 달 동안 활동해 왔다. 타이주는 센쿠가 과학으로 문명의 완전한 부흥을 일으키려는 거대한 계획을 세웠다는 것을 알게 된다. 타이주의 힘과 센쿠의 지성이 합쳐져 강력한 파트너십을 형성하고, 곧 석화된 자들을 되살리는 방법을 발견한다.
그러나 센쿠의 계획은 깨어난 자들이 그의 이념에 도전하면서 위협받는다. 한편, 인류가 석화된 이유는 여전히 알려지지 않았다.
[MAL Rewrite 작성]