Проведя год в Америке, Курису Макисэ возвращается в Акихабару и встречается с Ринтаро Окабэ. Однако их воссоединение прерывается, когда Окабэ начинает испытывать повторяющиеся вспышки других временных линий, так как последствия его путешествий во времени начинают проявляться. Эти побочные эффекты в конечном итоге приводят к тому, что Окабэ внезапно исчезает из мира, и только испуганная Курису помнит о его существовании. В отчаянии Курису сталкивается с поистине трудным выбором, который проверит как её долг учёного, так и её верность подруге: последовать совету Окабэ и держаться подальше от путешествий во времени, чтобы избежать возможных последствий для мировых линий, или игнорировать его, чтобы спасти человека, который ей дороже всего. Независимо от её решения, путь, который она выберет, повлияет на прошлое, настоящее и будущее. [Написано MAL Rewrite]