那个自称为疯狂科学家的古怪青年冈部伦太郎,如今已变得面目全非。在未能救出朋友牧濑红莉栖后,他陷入了抑郁和创伤之中,决定放弃他的疯狂科学家身份,像个普通大学生一样生活。周围的朋友对他的时间旅行经历知之甚少,冈部独自一人试图忘却那些冒险的恐怖,日复一日地消磨时光。
在大学科技论坛担任接待员时,冈部遇到了身材矮小、活泼开朗的比屋定真帆,她后来被发现是论坛演示会的翻译,由亚历克西斯·莱斯基宁教授主持。在震惊的人群面前,亚历克西斯和真帆揭开了Amadeus——一种革命性的人工智能,能够存储人的记忆并创建出完美的模拟体,包括他们的个性和怪癖。演示会后,冈部与真帆和亚历克西斯会面,得知两人曾是红莉栖在大学里的同事,并且他们在Amadeus中模拟了她。受亚历克西斯之聘研究该模拟的行为,冈部获得了与一位久违的挚友的影子互动的机会。危险地纠缠在过去中,冈部必须面对残酷的现实,并小心翼翼地应对扰乱自然时间流动所带来的灾难性后果。[来源:MAL Rewrite]