O ano é 2006, e os corredores da Escola Secundária de Jujutsu de Tóquio ecoam com as intermináveis discussões e debates intensos entre dois amigos inseparáveis. Exibindo uma confiança inabalável, Satoru Gojou e Suguru Getou acreditam que não há desafio grande demais para jovens e poderosos feiticeiros de Grau Especial como eles. Eles são encarregados de levar em segurança uma garota sensata chamada Riko Amanai até a entidade cuja existência é a própria essência do mundo jujutsu. No entanto, a missão os mergulha em um turbilhão exaustivo de conflitos morais que ameaça destruir a já frágil amizade entre feiticeiros e humanos comuns.
Doze anos depois, estudantes e feiticeiros são a linha de frente contra o crescente número de maldições de alto nível nascidas das emoções negativas humanas. À medida que as entidades ganham poder, sua autoconsciência e ambição também aumentam. As maldições se unem pelo objetivo comum de erradicar os humanos e criar um mundo apenas de usuários de energia amaldiçoada, lideradas por um perigoso espírito amaldiçoado antigo. Para eliminar seu maior obstáculo—o feiticeiro mais forte, Gojou—orquestram um ataque na Estação de Shibuya no Halloween. Dividindo-se em equipes, os feiticeiros entram na batalha prontos para arriscar tudo para proteger os inocentes e os seus.