Quando a ameaça dos anjos se intensifica, a força de defesa da humanidade é levada ao limite, com a NERV na vanguarda da luta. Shinji Ikari e sua parceira Rei Ayanami são auxiliados por dois novos pilotos: a fogosa Asuka Langley Shikinami e a misteriosa Mari Illustrious Makinami.
Com a ajuda de suas unidades Evangelion mecanizadas, equipadas com armas perfeitas para enfrentar seus oponentes monstruosos, as quatro jovens almas lutam desesperadamente para proteger seus entes queridos e evitar um apocalipse iminente. Mas quando segredos surpreendentes são revelados, será que o maior desafio dos heróis são os monstros... ou a própria humanidade?
[Escrito por MAL Rewrite]